著作权和专利权同属于知识产权大类，但实际上差别很大，以我个人的理解，专利权保护的是软件的运行逻辑，更加抽象，而软件著作权保护的是软件的代码，更加具象。

举例来说，要开发一款手机APP，为了适配iOS系统，使用了Objective-C语言开发出了iOS版本，为了适配Android系统，使用了Java语言开发出了Android版本，那么从软件著作权角度来看，这是两样作品，存在两件软件著作权。

种情况，如果有人抄袭了Java语言编写的Android版本的源代码，也只会侵犯该款版本的软件著作权，而与iOS版本的软件著作权无关。

第二种情况，如果有人在阅读了该款版本的源代码后，使用C语言重新编写了该款手机APP的源代码，并实现了该款手机APP的所有功能，但这种行为不会侵犯前述的两件软件著作权，因为C语言编写的源代码和两件软件著作权保护的源代码完全不同。

如果上述手机APP的某项功能还获得了专利授权，那么授权专利能够对该项功能的任何实现方式都进行保护，无论使用的是哪种编程语言，只要开发出的软件包含该项功能，就构成了专利侵权行为。

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